南疆,清朝时也称回部,指中国新疆维吾尔自治区天山以南的地区。依现行行政区划,包括今巴音郭楞蒙古自治州阿克蘇地區喀什地區克孜勒蘇柯爾克孜自治州和田地區等地,亦有把巴音郭楞蒙古自治州歸入東疆的分法。北疆、南疆、东疆新疆的三个地理分区

依现行行政区划区分的南疆、北疆东疆,蓝色为南疆地区,黄色为北疆地区,红色为东疆地区。

南疆和北疆以天山山脊线为界划分。汉朝在南疆设西域都护府魏晋时期设西域长史府唐朝统治西域安西都护府曾治南疆的龟兹,统辖“安西四镇”。十四世纪先后属于东察合台汗国吐鲁番汗国叶尔羌汗国清朝初年,南疆的回部臣属准噶尔汗国。清朝灭准噶尔汗国,平回部。1987年4月10日中央军委决定设立南疆军区,为正军级单位。负责管理南疆各军分区及西藏阿里军分区,归乌鲁木齐军区建制领导。