小笠原長房(おがさわらながふさ,生年不詳-明曆元年(1655))戰國時代後期江戶幕府前期武將。後北條氏後改德川氏幕府旗本。父小笠原康廣。幼名孫増丸。別名紹機、六郎、市左衛門、逢殿助。

根據〈寬政重修諸家譜〉記載,長房在天正2年(1574)2月19日接任家督。天正18年(1590)小田原合戰作為北條氏直的近習參與戰役。小田原開城後隨父親康廣和主君氏直一同在高野山出家。在氏直死後出仕德川家康。慶長元年(1596)被給予多摩郡300貫。

慶長5年關原之戰跟隨家康次子德川秀忠進攻真田昌幸真田信繁父子居城上田城,參與第二次上田城之戰。接著參與大坂之陣

元和9年(1623)任大番組頭,加增下總國香取郡200石。寬永20年(1643)退休,家業由長子長真繼承。