演化網路

演化網路（英語：Phylogenetic network）是以圖來表示生物的核酸序列、基因、染色體、基因組、和物種^[1]之间演化的關係。^[2]演化樹(英語：Phylogenetic tree)的樹狀結構不足以表達生物演化關係中雜交、基因水平轉移、遺傳重組、和基因重複等事件，因此演化網路容許在圖上存在些混合节點來表達此類關係。演化樹是演化網路的一個子集。演化網路可以被推測和被軟件可視化例如SplitsTree^[3]以及最近的軟件，Dendroscope。

參見编辑

参考资料编辑

^ D. H. Huson, R. Rupp and C. Scornavacca, Phylogenetic Networks （页面存档备份，存于互联网档案馆）, Cambridge University Press (2010).
^ Huson, DH and Scornavacca, C (2011). A survey of combinatorial methods for phylogenetic networks Genome Biology and Evolution, 3:23-35.
^ D. H. Huson and D. Bryant, Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies, Mol. Biol. Evol., 23(2):254-267, 2006.

Makarenkov, V., Kevorkov, D. and Legendre, P. (2006),Phylogenetic Network Reconstruction Approaches （页面存档备份，存于互联网档案馆）, Applied Mycology and Biotechnology, International Elsevier Series, vol. 6. Bioinformatics, 61-97.
[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆）, Who is Who in Phylogenetic Networks.

[network-1] D. H. Huson, R. Rupp and C. Scornavacca, Phylogenetic Networks （页面存档备份，存于互联网档案馆）, Cambridge University Press (2010).

[phylogenetic_networks-2] Huson, DH and Scornavacca, C (2011). A survey of combinatorial methods for phylogenetic networks Genome Biology and Evolution, 3:23-35.

[SplitsTree-3] D. H. Huson and D. Bryant, Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies, Mol. Biol. Evol., 23(2):254-267, 2006.

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