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真菌分类表

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子囊菌门 (Ascomycota)编辑

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    • Trichosphaeriales
    • 目未定及环境、菌根样本
  • Saccharomycetes
    • Saccharomycetales
  • 纲未定及环境、菌根样本

担子菌门 (Basidiomycota)编辑

  • Tremellomycetes
    • Cystofilobasidiales
    • Filobasidiales
    • Tremellales
    • Holtermanniales
    • 目未定
  • Dacrymycetes
    • Dacrymycetales
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    • †Prototaxales
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    • Cantharellales
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    • Wallemiales
    • Geminibasidiales
    • 目未定
  • 纲未定及环境、菌根样本

芽枝霉门(Blastocladiomycota)编辑

  • Blastocladiomycetes
    • Blastocladiales
    • 目未定
  • 环境样本

壶菌门(Chytridiomycota)编辑

  • Chytridiomycetes
    • Chytridiales
    • Cladochytriales
    • Lobulomycetales
    • Polychytriales
    • Rhizophlyctidales
    • Rhizophydiales
    • Spizellomycetales
    • 目未定
  • Monoblepharidomycetes
    • Monoblepharidales
  • 纲未定及环境样本

球囊菌门 (Glomeromycota)编辑

  • Glomeromycetes
    • Archaeosporales
    • Diversisporales
    • Glomerales
    • Paraglomerales
    • 目未定及环境样本
  • 纲未定及环境样本

微孢子虫门(Microsporidia)编辑

  • Minisporea
    • Minisporida
  • Microsporea
    • Microsporida
  • Metchnikovellea
    • Metchnikovellida
  • 纲未定及环境样本

新丽鞭毛菌门(Neocallimastigomycota)编辑

  • Neocallimastigomycetes
    • Neocallimastigales
  • 纲未定及环境样本

接合菌门 (Zygomycota)编辑

  • Zygomycetes
    • Endogonales
    • Mucorales
    • Mortierellales
    • Asellariales
    • Kickxellales
    • Dimargaritales
    • Harpellales
    • Entomophthorales
    • Zoopagales
    • 目未定

门未定及环境、菌根样本编辑

  • 其余的真菌种类(包括早期真菌种类及混合DNA片段)