考马斯亮蓝

化合物

考马斯亮蓝(Coomassie Brilliant Blue)是两种三苯甲烷衍生物染料(G-250和R-250)的统称,起初开发用于纺织行业,但现在通常用于分析生物化学中的蛋白质染色。考马斯亮蓝G-250比考马斯亮蓝R-250多两个甲基。其名“考马斯”是帝国化学工业下的一个注册商标。

考马斯亮蓝R-250
Skeletal formula of Coomassie Brilliant Blue R-250
Space-filling model of the Coomassie Brilliant Blue R-250 molecule
别名 C.I. 42660, C.I. Acid Blue 83
Brilliant indocyanine 6B, Brillantindocyanin 6B
Brilliant Cyanine 6B, Serva Blue R
识别
CAS号 6104-59-2  ✓
PubChem 61365
SMILES
性质
化学式 C45H44N3NaO7S2 (Sodium salt)
摩尔质量 825.97 g/mol g·mol⁻¹
溶解性 Insoluble in cold, slightly soluble in hot (bright red blue)
溶解性(ethanol) Slightly soluble
若非注明,所有数据均出自一般条件(25 ℃,100 kPa)下。
Coomassie Brilliant Blue G-250
别名 C.I. 42655, C.I. Acid Blue 90
Brilliant indocyanine G, Brillantindocyanin G
Xylene Brilliant Cyanine G, Serva Blue G
识别
CAS号 6104-58-1
PubChem 6324599
SMILES
KEGG D10799
性质
化学式 C47H50N3NaO7S2 (Sodium salt)
摩尔质量 856.03 g/mol g·mol⁻¹
溶解性 Slightly soluble in cold, soluble in hot (bright blue)
溶解性(ethanol) Soluble
若非注明,所有数据均出自一般条件(25 ℃,100 kPa)下。

起名和發現编辑

考马斯这个名字最初在19世纪末被一家设在英国Blackley的染料公司Levinstein Ltd.作为贸易名使用,用来售卖一些酸性羊毛染料。[1]1896年在第四次英国-阿散蒂战争期间, 英国军队占据了考马斯镇(今加纳库马西)。1918年, Levinstein Ltd.公司并入不列颠染料公司(British Deystuffs Cororation) ,后者在1926年成为帝国化学工业的一部分。[2]虽然帝国化学工业公司仍然持有考马斯这种商标,可是他们没有再生产这种染料。

這些藍色的二磺酸化三苯甲烷的染料首先在1913年由住在德國Elberfeld的Max Weiler生產[3]後來陸續發現了多種有機化學合成這種染料的方法。Var[4][5][6]

目前发表的生化論文中,通常把這些染料統稱“考馬斯”而不區分具體用的是哪種染料。實際上國際顏色索引列出了超過了四十種名字含有“考馬斯”的染,也有一些其他種類的(非二磺酸化三苯甲烷)的染料,也被叫作“考馬斯”藍。例如默克索引(第10版)列出了具有完全不同的結構的考馬斯藍。

染料的颜色编辑

後綴帶R的考馬斯亮藍R-250,R意指紅色,这是因為考馬斯亮藍R-250在藍色中略帶有紅色;而G型則意指Green,在藍色中帶有一點綠色。250起初是指染料的純度。

這兩種染料的顏色与溶液的酸堿性有关。考馬斯亮藍G型已經研究得比較詳細。[7]pH低於0的時候,呈現紅色,最大吸收峰位于465nm。在pH值約為1時,這種染料呈現綠色,最大吸收峰位于約620nm處。當pH高于2時,這種染料呈現一種亮藍色,最大吸收峰位于595nm。在pH為7的時候,這種染料的莫耳吸光度是43,000 M−1cm−1.[7]

染料分子呈現不同顏色的原因是分子不同的帶電荷狀態。在紅色形態時,全部三個氮原子均帶有正電。兩個磺酸基團有相當低的酸度係數,通常會帶負電,因而在pH為0左右時,整個染料分子會帶1個正電荷。綠色的形態則對應整體不帶電荷。而在中性介質(pH7)中,僅有二苯胺官能團上的氮原子帶有一個正電荷,所以整個分子帶有一個負電荷而呈藍色。這三個氮原子中前兩個失去質子的pKa分別是1.15和1.82。最后一個氮原子在強堿性環境下會失去質子,從而使染料變為粉色(pKa是12.4)[7]

考馬斯亮藍和蛋白質的氨基、羧基基團產生靜電作用,而非共價作用。染料分子和蛋白分子包括羊毛(角蛋白)形成一個蛋白質-染料分子複合物。 這種複合物的形成,使得染料的帶負電荷的形態得到了穩定,從而產生藍色,即使在多數分子帶正電荷的強酸環境下。[7] 這是布拉德福蛋白質定量法的理論依據,是一種利用考馬斯亮藍與蛋白質結合的蛋白質測定方法。這種染料與蛋白質的結合,使得考馬斯亮藍的吸收峰從465nm遷移到595nm。記錄595nm處吸光度的增加,可以用來測定蛋白質濃度。[8]

這種染料也會與陰離子去垢劑十二烷基硫酸鈉形成複合物。[9]這使得染料分子的綠色形態得到穩定。這個效應可以干擾布拉德福蛋白質定量法的測定。陰離子去垢劑也有可能與蛋白質競爭和染料分子結合。

生物化学中的用途编辑

考馬斯亮藍R-250在1964年被Fazekas de St.Groth的團隊最先用來觀察蛋白。蛋白樣品在醋酸纖維素薄膜上進行電泳分離。薄膜随后被放置于5-磺基水楊酸中,使蛋白质条带固定,然后将膜浸到染料溶液中。[10]

两年之后,1965年Meyer和Lambert用考马斯亮蓝R-250去染经聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质样品。他们将胶浸在含有甲醇乙酸和水的溶液中。由于染料在染色蛋白质的同时也染了聚丙烯酰胺凝胶,为了使蛋白质条带可见,他们对电泳的凝胶进行了脱色。[11]后续的文献报道聚丙烯酰胺凝胶可以被乙酸溶液成功脱色。

在1967年,首次出现使用考马斯亮蓝G让聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白条带变得可见的报道,其中染料被溶解在含有甲醇的乙酸溶液中。[12]之后发现,如果使用溶解在不含甲醇的三氯乙酸考马斯亮蓝G胶体,可以使蛋白质条带被染色,而聚丙烯酰胺不被染色。如果用这种方法,就没有必要再对胶进行脱色。[13]现代的手段通常是将考马斯亮蓝G溶解在含有磷酸、乙醇(或甲醇)和硫酸铵(或硫酸铝)的溶液中。[14][15][16][17]

布拉德福蛋白质定量法利用了考马斯亮蓝G-250的光谱性质去检测溶液中的蛋白质含量。[18]将蛋白质样品加入到染料的磷酸和乙醇的溶液中。在酸性环境中,这种染料通常呈现棕红色,但是结合了蛋白质之后,染料形成蓝色形态。溶液的吸光度在595nm波长处测定。这种染料非常著名,因为它有高灵敏性,即使只有5μg蛋白也足以使染料变色。然而,这种方法有一个缺点是变色程度因蛋白质种类不同而不同:单位量蛋白质带来的吸光度改变取决于蛋白质的类型。[19]

与蛋白质结合后,带负电荷的考马斯亮蓝G-250分子会让蛋白质整体带上负电荷。这个性质可以被用来分离蛋白质或蛋白质复合物,使用非变性条件下的聚丙烯酰胺凝胶电泳——Blue Native PAGE电泳。[20][21]这样的复合体的迁移能力既取决于蛋白质复合体的分子质量,也取决于结合到蛋白质上的染料量。

考马斯亮蓝染色,也可以用于western印迹分析中的一步。[22]它的作用是先于抗体的染色,使之可以作为对照。

药理用途编辑

2009年,考马斯亮蓝G在实验中被用来治疗实验室大鼠的脊髓损伤[23]它通过减少个体肿胀反应而生效,而肿胀反应会导致损伤区域的神经元死于代谢的压力。这个方法在大鼠上测试有效。两组脊髓损伤大鼠中,一组给予考马斯亮蓝G处理,一组没有处理。测试结果证明,相较于没有处理的大鼠,用染料处理的大鼠可以更好的运动,并且在运动测试中取得更高的得分。[24] 这种治疗能否用在人类身上的相关测试还在进行中。近期的实验中曾在损伤后15分钟后,施予染料治疗有效。但是在现实生活中,病人需要一定时间才能赶到急救室,所以这种治疗应该即使在受伤后两小时后施放仍然有效。唯一报道的副作用是大鼠会短暂的变蓝。[23][25][26]

亮蓝G作为染料可以被外科医生使用来完成视网膜手术,它的贸易名是Brilliant Peel.[27]

法医学应用编辑

纽约州立大学奥尔巴尼分校的一个实验,反应了考马斯染料可以去靶向结合芳香族氨基酸(苯丙氨酸,酪氨酸,色氨酸)和碱性侧链氨基酸(赖氨酸,精氨酸和组氨酸),从而使得布拉德福分析可以用来做指纹的分析。布拉福德分析已经可以成功的用来检测指纹的男女属性。女性指纹样品相较于男性指纹样品,会带来更高的吸收峰(在相近波长下)。这提供了一种更简单的指纹分析方法,将需要分析的氨基酸数从23个减少到了6个,而且相对于茚三酮化学测定方法,需要的准备工作量更少,因为茚三酮测定法需要加热、酶联反应等。[28]

参考文献编辑

  1. ^ Fox, M. R. Dye-makers of Great Britain 1856-1976 : A History of Chemists, Companies, Products and Changes. Manchester: Imperial Chemical Industries. 1987: 38. 
  2. ^ Fox, M. R. Dye-makers of Great Britain 1856-1976 : A History of Chemists, Companies, Products and Changes. Manchester: Imperial Chemical Industries. 1987: 259. 
  3. ^ Colour Index (PDF) 4 3rd. Bradford: Society of Dyers and Colourists. 1971: 4397–4398 [2018-04-10]. (原始内容 (pdf)存档于2011-07-19). 
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延伸阅读编辑

  • Gessner, T.; Mayer, U. Triarylmethane and Diarylmethane Dyes. Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry 6th Edition. Weinheim: Wiley-VCH. 2002. ISBN 3527306730. doi:10.1002/14356007.a27_179{{inconsistent citations}} 

外部链接编辑