Rp3病毒
蝙蝠冠狀病毒Rp3（Bat SARS-CoV/Rp3/2004）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，為SARS-CoV相關病毒，在中國廣西的皮氏菊頭蝠樣本中發現，於2005年發表。
Rp3病毒
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病毒分類 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | Rp3病毒 SARSr-CoV
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| 毒株： | Rp3病毒 Rp3
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發現 编辑
2004年3月至11月，研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本，在廣西南寧皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒，即Rp3病毒，於2005年和Rf1病毒與Rm1病毒一起發表[1]。
基因組 编辑
Rp3病毒的基因組長29736nt[2]，序列與SARS-CoV的相似度為92.6%[3]，其ORF8和人類以外的大多數SARSr-CoV一樣有一段長29nt的插入序列，為一完整的開放閱讀框，人類的ORF8則因缺少此序列而被分成8a與8b兩個較小的開放閱讀框。Rp3的ORF8（121個胺基酸）比人類SARS病毒ORF8輔助蛋白（121個胺基酸）少一個胺基酸，且兩者胺基酸序列相似度僅35%[1]。另外Rp3與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失（但不見於WIV1病毒與SHC014病毒）[4]。
演化樹 编辑
截至2021年1月[update]，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：
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SARS-CoV-2 79 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
參考文獻 编辑
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）.
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