低分子量RNA型

低分子量RNA型(low molecular weight RNA pattern, LMW-RNA pattern),又称低分子量RNA指纹(LMW-RNA fingerprinting)是一种电泳技术,用来分离小分子量的RNA,如5S rRNA(107~131nt)、第二族tRNA(82~96nt)、第一族tRNA(72~79nt)等。

对于纯菌株,tRNA和5S rRNA的指纹图谱可用于鉴别基因型和分类(5S rRNA用于不同,tRNA用于不同)。

分子生态学中,低分子量RNA型的5S rRNA带可以给出群落多样性的概貌。

实验步骤为:

  1. 提取总RNA
  2. 放射性同位素标记rRNA
  3. 高分辨率的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
  4. 放射自显影