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南摩鹿加包含馬來群島中摩鹿加群島南部的150餘個島嶼。主要的島嶼有塞蘭島、安汶島、布魯島。南摩鹿加地區居民多為基督教徒，約有100萬。該地區行政上屬摩鹿加省。該地為原南摩鹿加共和國的所在地，為南摩鹿加獨立運動的策源地。
1949年，印尼在脫離荷蘭殖民統治的的獨立戰爭中獲勝後，原屬荷屬東印度一部分的南摩鹿加拒絕加入獨立後的印尼，1950年4月，該地成立了南摩鹿加共和國，1950年11月印尼軍隊攻佔南摩鹿加，流亡政府在荷蘭成立。