印度尼西亞河流列表

印度尼西亞河流列表，列舉全部或部分在印度尼西亞境內的河流，並依照流域排列。支流則由河口至源頭排序。

蘇門答臘島

• 穆西河

爪哇島

• 芝利翁河
• 芝塔龍河
• 布蘭塔斯河
• 梭羅河

加里曼丹島（婆羅洲）

• 卡普阿斯河
• 卡哈揚河
• 馬哈坎河

帝汶島

• 洛伊斯河：跨國河流，中游為印尼與東帝汶界河，下游位於東帝汶境內。

新幾內亞島

• 塞皮克河：跨國河流，上、下游皆在巴布亞紐幾內亞境內。
• 曼伯拉莫河
  • 塔里庫河
  • 塔里塔圖河
• 馬老河