程纯枢于1936年毕业于清华大学地理系。此后曾先后在上海欧亚航空公司、中央研究院气象研究所、西安测候所、重庆中央气象局等地工作。1945年前往美国,在芝加哥大学、美国气象局水文气象处实习。次年返国,历任南京中央气象局处长、上海气象台台长。
中华人民共和国成立后,出任华东军区气象处副处长。1954年起任职于中央气象局气象台、气象研究所、观象台,曾任副所长、副台长、总工程师。1965年起任国家气象局总工程师、副局长。1980年当选中国科学院地学部学部委员(院士)。
1997年2月逝世。
- 程纯枢. 中国科学院. (原始内容存档于2010-10-28).
- 北极阁与院士. 新华网江苏频道. 2007-09-11. [永久失效連結]
- 徐友春 (编). 《民国人物大辞典》. 河北人民出版社. 1991.