酸桿菌門（Acidobacteria）是新近被分出的一門細菌。它們是嗜酸菌。現在對它們研究還很少，但它們在生態系統中具有重要作用，比如土壤中。
酸杆菌门
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科学分类 
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| 域：
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细菌域 Bacteria
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| 界：
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细菌界 Bacteria
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| 门：
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酸杆菌门 Acidobacteriota
Thrash and Coates, 2012
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| 屬
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- 酸桿菌屬 Acidobacterium
- Geothrix
- Holophaga
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酸桿菌綱(Acidobacteria)
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- 酸桿菌目(Acidobacteriales)
- 酸桿菌科(Acidobacteriaceae)
- 酸桿菌屬(Acidobacterium)
- (Edaphobacter)
- (Terriglobus)
全噬菌綱(Holophagae)
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- 石鱉桿菌目(Acanthopleuribacterales)
- 石鱉桿菌科(Acanthopleuribacteraceae)
- 石鱉桿菌屬(Acanthopleuribacter)
- 全噬菌目(Holophagales)
