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遗传距离(Genetic distance)是用来衡量物种之间或同一物种的群体之间的遗传分化的指标。[1]对某一基因来说,两个群体有类似的等位基因,且频率相似,彼此的遗传距离较小,说明他们的共同起源比较近。

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常用遗传距离编辑

根井标准距离编辑

1972年,日裔美国群体遗传学家根井正利Masatoshi Nei)提出了一种遗传距离的计算方法,后来被称为“根井标准距离”(英语:Nei's standard genetic distance)。这种方法假设遗传差异是突变漂变两个因素造成的,适用于每年或每个世代的遗传变化速率稳定的情况。在这种情况下,群体间的根井标准距离(D)与彼此分化的时间成正比,公式如下[2]

 

卡瓦利-斯福扎距离编辑

雷诺兹遗传距离编辑

In 1983年,约翰·雷诺兹(John Reynolds)、B·S·维尔(B.S. Weir)和考克汉姆(C. Clark Cockerham)提出了一种后来得名“雷诺兹遗传距离”(Distance de Reynolds)的方法,假设群体的遗传分化中没有突变的作用,而完全是漂变导致的情况下,共祖参数(Coancestry coefficient)  可以用于遗传距离的量度,计算为[3]

 

参考文献编辑

  1. ^ Nei, M. Molecular Evolutionary Genetics. (Chapter 9). New York: Columbia University Press. 1987. 
  2. ^ Nei, M. Genetic distance between populations. Am. Nat. 1972, 106: 283–292. doi:10.1086/282771. 
  3. ^ John Reynolds; B.S. Weir; C. Clark Cockerham. Estimation of the coancestry coefficient: Basis for a short-term genetic distance. Genetics. November 1983, 105: 767–779.