噬病毒體
噬病毒體(Virophages)類似衛星病毒,但它抑制或損害輔助病毒。與其他衛星病毒類似,噬病毒體依賴於另一種病毒混合感染宿主。噬病毒體危害其輔助病毒的繁殖。儘管越來越多的科學文獻中參考噬病毒體概念,但也有一些爭議,它像一個獨立的種類,而不同於其他衛星病毒。[1][2]
噬病毒體能將宿主病毒和其他微生物的基因轉移到自己的基因組中,體現了顯著的基因混合效果。Sputnik 2噬病毒體還含有可以在細胞基因組內移動的小型鏈狀DNA序列轉座病毒體(transpovirons)。這種轉座病毒體能隨機插入到隱形眼鏡病毒和其他擬菌病毒科成員的基因組中,這種噬病毒體可能可以把轉座病毒體的DNA轉移到巨型病毒宿主中,轉座病毒體和噬病毒體可能通過病毒間基因轉移而了影響了巨型病毒基因組。
目前已經發現的噬病毒體有: 噬病毒體目前提出的分類屬於大病毒依賴科Lavidaviridae, 包含兩個屬衛星屬Sputnikvirus和獨特屬Mavirus[3]。
- 衛星噬病毒體(Sputnik virophage),侵染以變形蟲為宿主的媽媽病毒(mamavirus)。[4]
- 衛星噬病毒體 2(Sputnik 2 virophage),也被稱為超噬病毒體(provirophage),能幹擾巨型病毒隱形眼鏡病毒(Lentillevirus)。[5]
- 鄰居噬病毒體(Zamilon virophage),攻擊擬菌病毒(Mimivirus)[6]。在美國北部發現了Zamilon 2。研究者發現有一些擬菌病毒可以抵禦Zamilon的入侵,在這些擬菌病毒的基因組內發現了Zamilon的基因片段(規律間隔成簇短回文重複序列 Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, CRISPR)。如果在這些擬菌病毒的基因組上清除這個片段所在的基因,擬菌病毒便失去了抵禦Zamilon的能力。在這個基因的附近,還找到了類似細菌Cas蛋白的核酸酶,擬菌病毒的免疫系統作用的原理和細菌的CIRSPR/Cas類似。大病毒將感染它的噬病毒體的基因片段插入到自己的基因組裏,這些基因片段會將核酸酶引導到入侵者的基因組上,核酸酶會將噬病毒體的基因組切斷,從而阻止它進一步複製擴增。擬菌病毒中發現的免疫系統稱為:MIMIVIRE(mimivirus virophage resistance element,擬菌病毒噬病毒體抵抗元件)。[7]
- 獨特噬病毒體(Mavirus virophage),它的目標是一種巨型病毒CroV,CroV侵染一種鞭毛蟲。[8]
- 有機湖噬病毒體(Organic Lake virophage, OLV),藻類DNA病毒(phycoDNAviruses)是一種攻擊海藻的大病毒,而有機湖噬病毒體則能攻擊這些藻類DNA病毒。[9]
參考資料
編輯- ^ Fischer MG (2012) Sputnik and Mavirus: more than just satellite viruses. Nat Rev Microbiol. 2011 Dec 5;10(1):88. doi: 10.1038/nrmicro2676-c1
- ^ Krupovic M, Cvirkaite-Krupovic V. (2012) Sputnik and Mavirus: not more than just satellite viruses. Nat Rev Microbiol. 10(1):78. doi: 10.1038/nrmicro2676-c2
- ^ Krupovic M, Kuhn JH, Fischer MG. A classiㄅㄆㄇfication system for virophages and satellite viruses. Arch Virol. 2016, 161: 233–247. PMID 26446887. doi:10.1007/s00705-015-2622-9.
- ^ Bernard La Scola; et al. The virophage as a unique parasite of the giant mimivirus. Nature. 2008, 455 (7205): 100–4. PMID 18690211. doi:10.1038/nature07218.
- ^ Christelle Desnuesa, Bernard La Scolaa, Natalya Yutinb, Ghislain Fournousa, Catherine Roberta, Saïd Azzaa, Priscilla Jardota, Sonia Monteila, Angélique Campocassoa, Eugene V. Kooninb, and Didier Raoulta, Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses ,Published online before print October 15, 2012, doi: 10.1073/pnas.1208835109 ,PNAS October 15, 2012 201208835
- ^ Gaia M, Benamar S, Boughalmi M, Pagnier I, Croce O, Colson P, Raoult D, La Scola B, Zamilon, a Novel Virophage with Mimiviridae Host Specificity, PLoS One, 2014, 9: e94923 [2016-03-27], doi:10.1371/journal.pone.0094923, (原始內容存檔於2020-07-29)
- ^ Levasseur A, Bekliz M, Chabrière E, Pontarotti P, La Scola B & Raoult D. MIMIVIRE is a defence system in mimivirus that confers resistance to virophage. Nature, Published online 29 February 2016 La Scola, B et al. A giant virus in amoebae. Science 2003; 299:2033 Pearson H. 'Virophage' suggests viruses are alive. Nature 2008; 454:677
- ^ Fischer MG, Matthias G. and Curtis A. Suttle (2011) A virophage at the origin of large DNA transposons. Science 332 (6026) 231-234
- ^ Yau S, Lauro FM, Demaere MZ, Brown MV, Thomas T, Raftery MJ, Andrews-Pfannkoch C, Lewis M, Hoffman JM, Gibson JA, & Cavicchioli R (2011). Virophage control of antarctic algal host-virus dynamics. Proc Nat Acad Sci USA