密蘇里州州旗為前州參議員奧立佛(R.B. Oliver)的妻子瑪麗.奧立佛(Marie Elizabeth Watkins Oliver)所設計,於1913年起採用並延續至今。
此旗的背景由三個橫條所構成,由上而下為紅色(代表勇氣)、白色(代表純潔)、藍色(代表警惕與公正),這三個顏色同時也象徵着曾經統治此州的新法蘭西。在白色橫條的中央為密蘇里州州徽,為藍色圓框以及24個星形所圍繞,代表了密蘇里州是美國的第24州。