核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶

現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（舊版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英語：PDBsum）	結構概要
PDB	1aa1, 1aus, 1bwv, 1bxn, 1ej7, 1geh, 1gk8, 1ir1, 1ir2, 1iwa, 1rba, 1rbl, 1rbo, 1rco, 1rcx, 1rld, 1rsc, 1rus, 1rxo, 1svd, 1tel, 1upm, 1upp, 1uw9, 1uwa, 1uzd, 1uzh, 1wdd, 1ykw, 2cwx, 2cxe, 2d69, 2qyg, 2rus, 2v63, 2v67, 2v68, 2v69, 2v6a, 3rub, 4rub, 5rub, 8ruc, 9rub

RuBisCO large chain,
catalytic domain
RuBisCO large chain,; catalytic domain
鑑定
標誌	RuBisCO_large
Pfam	PF00016（舊版）
InterPro（英語：InterPro）	IPR000685
PROSITE（英語：PROSITE）	PDOC00142
SCOP（英語：Structural Classification of Proteins）	3rub / SUPFAM
Pfam
現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（舊版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英語：PDBsum）	結構概要
PDB	1aa1, 1aus, 1bwv, 1bxn, 1ej7, 1geh, 1gk8, 1ir1, 1ir2, 1iwa, 1rba, 1rbl, 1rbo, 1rco, 1rcx, 1rld, 1rsc, 1rus, 1rxo, 1svd, 1tel, 1upm, 1upp, 1uw9, 1uwa, 1uzd, 1uzh, 1wdd, 1ykw, 2cwx, 2cxe, 2d69, 2qyg, 2rus, 2v63, 2v67, 2v68, 2v69, 2v6a, 3rub, 4rub, 5rub, 8ruc, 9rub

Ribulose-bisphosphon ate carboxylase
	圖示RuBisCo四級結構的空間填充模型，可以看到以二聚體存在的的主鏈（灰/白）和小的側鏈（藍/橙）。
命名
系統命名
縮寫
識別碼
EC編號	4.1.1.39
CAS號	9027-23-0
數據庫
IntEnz	IntEnz瀏覽
BRENDA（英語：BRENDA）	BRENDA入口
ExPASy（英語：ExPASy）	NiceZyme瀏覽
KEGG	KEGG入口
MetaCyc（英語：MetaCyc）	代謝路徑
PRIAM（英語：PRIAM_enzyme-specific_profiles）	概述
PDB	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
基因本體	AmiGO / EGO
搜索
PMC	相關文獻
PubMed	相關文獻

1,5-二磷酸核酮糖羧化酶／加氧酶（英語：Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase，通常簡寫為RuBisCO）是一種酶（EC 4.1.1.39），它在光合作用中卡爾文循環裏催化第一個主要的碳固定反應，將大氣中游離的二氧化碳轉化為生物體內儲能分子，比如蔗糖分子。1,5-二磷酸核酮糖羧化酶／加氧酶可以催化1,5-二磷酸核酮糖與二氧化碳的羧化反應或與氧氣的氧化反應。同時RuBisCO也能使RuBP進入光呼吸途徑。

1,5-二磷酸核酮糖羧化酶／加氧酶可能是地球上含量最多的蛋白質^[1]。從化學角度來說，它催化核酮糖-1,5-二磷酸（也稱為 RuBP）的羧化。^[2]^[3]^[4]

替代的碳固定途徑

RuBisCO 在生物學上很重要，因為它催化無機碳進入生物圈的主要化學反應。雖然許多自養的細菌和古菌通過還原性乙酰輔酶A途徑、3-Hydroxypropionate bicycle或還原型檸檬酸循環固定碳，但與 RuBisCO 催化的碳固定相比，這些途徑對全球碳固定的貢獻相對較小。與 RuBisCO 不同，磷酸烯醇丙酮酸羧化酶 (Phosphoenolpyruvate carboxylase) 只能暫時固定碳。RuBisCO 是葉子中最豐富的蛋白質，反映了其重要性，占C3植物可溶性葉蛋白的 50%（占葉總氮的 20-30%）和C4植物可溶性葉蛋白的 30%（占葉總氮的 5-9%）。^[4] 鑑於其在生物圈中的重要作用，作物中 RuBisCO 的基因工程持續受到關注。

RuBisCO, N-terminal domain

鑑定

標誌

RuBisCO_large_N

Pfam

PF02788（舊版）

InterPro（英語：InterPro）

IPR017444

SCOP（英語：Structural Classification of Proteins）

3rub / SUPFAM

現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（舊版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英語：PDBsum）	結構概要
PDB	1aa1, 1aus, 1bwv, 1bxn, 1ej7, 1geh, 1gk8, 1ir1, 1ir2, 1iwa, 1rba, 1rbl, 1rbo, 1rco, 1rcx, 1rld, 1rsc, 1rus, 1rxo, 1svd, 1tel, 1upm, 1upp, 1uw9, 1uwa, 1uzd, 1uzh, 1wdd, 1ykw, 2cwx, 2cxe, 2d69, 2qyg, 2rus, 2v63, 2v67, 2v68, 2v69, 2v6a, 3rub, 4rub, 5rub, 8ruc, 9rub

RuBisCO, small chain

鑑定

標誌

RuBisCO_small

Pfam

PF00101（舊版）

InterPro（英語：InterPro）

IPR000894

SCOP（英語：Structural Classification of Proteins）

3rub / SUPFAM

現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（舊版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英語：PDBsum）	結構概要
PDB	1aa1, 1aus, 1bwv, 1bxn, 1ej7, 1gk8, 1ir1, 1ir2, 1iwa, 1rbl, 1rbo, 1rco, 1rcx, 1rlc, 1rld, 1rsc, 1rxo, 1svd, 1upm, 1upp, 1uw9, 1uwa, 1uzd, 1uzh, 1wdd, 2v63, 2v67, 2v68, 2v69, 2v6a, 3rub, 4rub, 8ruc

參見

參考資料

^ 解開生命之謎：運用量子生物學，揭開生命起源與真相的前衛科學 p143
^ Cooper GM. 10.The Chloroplast Genome. The Cell: A Molecular Approach 2nd. Washington, D.C.: ASM Press. 2000. ISBN 978-0-87893-106-4. , one of the subunits of ribulose bisphosphate carboxylase (rubisco) is encoded by chloroplast DNA. Rubisco is the critical enzyme that catalyzes the addition of CO₂ to ribulose-1,5-bisphosphate during the Calvin cycle. It is also thought to be the single most abundant protein on Earth, so it is noteworthy that one of its subunits is encoded by the chloroplast genome.
^ Dhingra A, Portis AR, Daniell H. Enhanced translation of a chloroplast-expressed RbcS gene restores small subunit levels and photosynthesis in nuclear RbcS antisense plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. April 2004, 101 (16): 6315–6320. Bibcode:2004PNAS..101.6315D. PMC 395966  . PMID 15067115. doi:10.1073/pnas.0400981101  . (Rubisco) is the most prevalent enzyme on this planet, accounting for 30–50% of total soluble protein in the chloroplast;
^ ^4.0 ^4.1 Feller U, Anders I, Mae T. Rubiscolytics: fate of Rubisco after its enzymatic function in a cell is terminated. Journal of Experimental Botany. 2008, 59 (7): 1615–1624. PMID 17975207. doi:10.1093/jxb/erm242  .

[1] 解開生命之謎：運用量子生物學，揭開生命起源與真相的前衛科學 p143

[2] Cooper GM. 10.The Chloroplast Genome. The Cell: A Molecular Approach 2nd. Washington, D.C.: ASM Press. 2000. ISBN 978-0-87893-106-4. , one of the subunits of ribulose bisphosphate carboxylase (rubisco) is encoded by chloroplast DNA. Rubisco is the critical enzyme that catalyzes the addition of CO₂ to ribulose-1,5-bisphosphate during the Calvin cycle. It is also thought to be the single most abundant protein on Earth, so it is noteworthy that one of its subunits is encoded by the chloroplast genome.

[Dhingra_2004-3] Dhingra A, Portis AR, Daniell H. Enhanced translation of a chloroplast-expressed RbcS gene restores small subunit levels and photosynthesis in nuclear RbcS antisense plants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. April 2004, 101 (16): 6315–6320. Bibcode:2004PNAS..101.6315D. PMC 395966  . PMID 15067115. doi:10.1073/pnas.0400981101  . (Rubisco) is the most prevalent enzyme on this planet, accounting for 30–50% of total soluble protein in the chloroplast;

[Feller_2008-4] 4.0 ^4.1 Feller U, Anders I, Mae T. Rubiscolytics: fate of Rubisco after its enzymatic function in a cell is terminated. Journal of Experimental Botany. 2008, 59 (7): 1615–1624. PMID 17975207. doi:10.1093/jxb/erm242  .

[1]

[2]

[3]

[4]