薛祖學（？—1556年1月23日），陝西西安府渭南縣人，民籍。明朝政治人物。
正德八年（1513年）癸酉科陝西鄉試舉人，九年（1514年）聯捷甲戌科三甲第三十名進士[1][2]，初授四川內江縣知縣，擢升兵部主事，歷郎中，以事貶和州同知，官至泗州知州[3]。嘉靖三十四年（1556年）臘月十二日子時（23:00～24:00），因在地震時落入一丈多深的水穴被淹死。
