海军总司令部（德语：Oberkommando der Marine，常缩写为“OKM”）是存在于1859年至1871年期间的普鲁士皇家海军最高指挥机关。
在“普鲁士战争部”部长阿德尔伯特亲王（德语：Adalbert von Preußen (1811–1873)）的主导下建立了德国人的第一支现代化海军，并于1859年3月14日将统帅权分离成“海军总司令部”以及直属普鲁士国王的“海军局（德语：Marineministerium (Deutschland)）”。在德意志帝国建立后，普鲁士王国的“海军总司令部”被并入帝国中央的“帝国海军部”，其权力分给了后者和“海军总监（德语：Generalinspekteur der Marine）”。
前后共两任海军总司令：