施德馨为康熙十九年（1680年）庚申科举人，授建安教谕，升任福州府学教授。康熙四十八年（1709年）调任台湾府儒学教授。秩满后，本可升任知县，却推辞不就。
据《台湾通志·列传·政绩》载，有以下文字描述施德馨：
- “施德馨，字闻于，晋江人．南靖籍，康熙庚申举人，授建安教谕．先是学官，为县征士子粮．德馨谢之曰：‘司铎闻教士，不闻催科’．悉以属县，捐俸修文庙、开泮池、建启圣祠．学校改观，士风日上．迁福州教授，移台湾。秩满，升知县，不就。德馨为诸生时，即以文章气节著。康熙十七年，海寇施亥梏其兄，德馨代之；守者纵之逸。德馨曰：‘吾去子能免乎？何忍求生而贻子死！’亥闻竟释之。其调台湾也，海疆新辟，初建学设官。巡抚张伯行，以德馨文学精粹，居官清谨，任之。士子咸被其化，孙世瑚，乾隆庚辰举人。（《福建通志》、《泉州府志》)。”
