LIM结构域
LIM结构域（英语：LIM domain）是一种蛋白质结构域，由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成[1]，其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白（Lin11, Isl-1 & Mec-3）的首字母[2]。LIM结构域介导蛋白质交互作用，参与细胞骨架组建，在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。
| LIM domain | |||||||||||
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 Pinch蛋白的第四个LIM结构域，锌原子为灰色 | |||||||||||
| 鉴定 | |||||||||||
| 标志 | LIM | ||||||||||
| Pfam | PF00412（旧版） | ||||||||||
| InterPro | IPR001781 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC50178 | ||||||||||
| SCOP | 1ctl / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd08368 | ||||||||||
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除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外，LIM结构域的氨基酸序列高度可变，其通式如下：
[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]
参考文献
编辑- ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499.
- ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.