维甲酸诱导基因-I

维甲酸诱导基因-I[5]RIG-I,retinoic acid-inducible gene I)是脊椎动物细胞质中的一种模式识别受体(PRR),结构上属于DExD/H-box英语DExD/H box proteinsRNA解旋酶[6][7][8],在人类基因组中由DDX58基因编码[9],其N端有两个CARD结构域英语CARD domainC端则可与RNA结合,为先天免疫反应中的重要蛋白[6][7]

DDX58
已知的结构
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
识别号
别名DDX58;, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1
外部IDOMIM609631 MGI2442858 HomoloGene32215 GeneCardsDDX58
基因位置(人类
9号染色体
染色体9号染色体[1]
9号染色体
DDX58的基因位置
DDX58的基因位置
基因座9p21.1起始32,455,302 bp[1]
终止32,526,208 bp[1]
RNA表达模式
查阅更多表达数据
直系同源
物种人类小鼠
Entrez
Ensembl
UniProt
mRNA​序列

NM_014314

NM_172689

蛋白序列

NP_055129

NP_766277

基因位置​(UCSC)Chr 9: 32.46 – 32.53 MbChr 4: 40.2 – 40.24 Mb
PubMed​查找[3][4]
维基数据
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RIG-I平时处于不活化状态,在细胞被西尼罗河病毒黄热病毒英语Flavivirus日本脑炎病毒A型流感病毒仙台病毒冠状病毒RNA病毒感染后[6][10],RIG-I可与病毒的双股RNA(dsRNA)结合而被活化,接著即可以CARD结构域和粒线体外膜上的线粒体抗病毒信号蛋白英语Mitochondrial antiviral-signaling protein(MAVS)结合[7],启动第一型干扰素英语Interferon type I(IFN I)途径的免疫反应[6],后者可阻止病毒扩散、造成发炎反应以及协助活化后天免疫[11]。除识别病毒RNA外,在不同癌细胞中RIG-I还能启动其他反应,包括促进或抑制肿瘤增殖(因肿瘤类型而异)、活化B细胞、影响细胞分化[12]。有些无脊椎动物牡蛎)也具有和RIG-I与MAVS同源的蛋白,且可能也有抗病毒的免疫功能[13]

不活化与活化的RIG-I结构示意图

参考文献

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  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107201 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040296 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ 存档副本. [2021-07-06]. (原始内容存档于2021-07-09). 
  6. ^ 6.0 6.1 6.2 6.3 Kell AM, Gale M. RIG-I in RNA virus recognition. Virology. May 2015,. 479-480: 110–21. PMC 4424084 . PMID 25749629. doi:10.1016/j.virol.2015.02.017. 
  7. ^ 7.0 7.1 7.2 Brisse M, Ly H. Comparative Structure and Function Analysis of the RIG-I-Like Receptors: RIG-I and MDA5. Frontiers in Immunology. 2019, 10: 1586. PMC 6652118 . PMID 31379819. doi:10.3389/fimmu.2019.01586 (英语). 
  8. ^ Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor. Protein & Cell. March 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270 . PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
  9. ^ DDX58 DExD/H-box helicase 58 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-02-29]. (原始内容存档于2021-04-24). 
  10. ^ Solis M, Nakhaei P, Jalalirad M, Lacoste J, Douville R, Arguello M, et al. RIG-I-mediated antiviral signaling is inhibited in HIV-1 infection by a protease-mediated sequestration of RIG-I. Journal of Virology. February 2011, 85 (3): 1224–36. PMC 3020501 . PMID 21084468. doi:10.1128/JVI.01635-10. 
  11. ^ Ivashkiv LB, Donlin LT. Regulation of type I interferon responses. Nature Reviews. Immunology. January 2014, 14 (1): 36–49. PMC 4084561 . PMID 24362405. doi:10.1038/nri3581. 
  12. ^ Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor.. Protein Cell. 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270 . PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
  13. ^ Huang B, Zhang L, Du Y, Xu F, Li L, Zhang G. Characterization of the Mollusc RIG-I/MAVS Pathway Reveals an Archaic Antiviral Signalling Framework in Invertebrates.. Sci Rep. 2017, 7 (1): 8217. PMC 5557890 . PMID 28811654. doi:10.1038/s41598-017-08566-x.