PyMOL
PyMOL是一个开放源码，由使用者赞助的分子三维结构显示软件。由Warren Lyford DeLano编写，并且由DeLano Scientific LLC将它商业化。DeLano Scientific LLC是一个私人的软体公司，它致力于创造让普遍的科学与教育社群都能取得的好用软体工具。
 PyMOL的使用界面：包括一个图形显示窗口和一个GUI窗口。 | |
| 开发者 | DeLano Scientific LLC |
|---|---|
| 当前版本 | |
| 源代码库 | |
| 操作系统 | Windows、各类Linux和Unix、OSX |
| 类型 | 分子建模 |
| 许可协议 | 开放源码，使用者赞助 |
| 网站 | pymol.sourceforge.net |
PyMOL适用于创作高品质的小分子或是生物大分子（特别是蛋白质）的三维结构图像。软体的作者宣称，在所有正式发表的科学文献中的蛋白质结构图像中，有四分之一是使用PyMOL来制作。
PyMOL是少数可以用在结构生物学领域的开放源代码视觉化工具。
软体以Py+MOL命名：“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的，“MOL”表示它是用于显示分子（英文为molecule）结构的软件。
商业化举措 编辑
自2006年8月1日起，DeLano Scientific对于事先编译过的PyMOL执行程式（包括beta版）的取得采取限定下载的措施。 目前，完全无限制的可执行程序只有付费用户可以取得。学生和教师可以通过一项声明来取得教育版PyMOL以用于教学和其它受限制的领域。用户还可以在一定时间内免费使用评估版本，以便于决定是否购买该软件。
PyMOL的源代码目前仍可以免费下载，供使用者编译。对于Linux、Unix以及Mac OS X等操作系统，非付费用户可以通过自行编译源代码来获得PyMOL执行程式；而对于Windows的使用者，如果不安装第三方软件，则无法编译源代码。这表示使用Windows的用户取得新版PyMOL（PyMOL1.0及之后的版本）执行程式的方式就是成为付费会员，或者使用第三方软件（如Cygwin）进行编译[3]。
类似软件 编辑
参考文献 编辑
- ^ Release 2.5.0. 2021年5月10日 [2021年5月16日].
- ^ PyMOL v2.5.5 Maintenance Release. 2023年3月27日 [2023年10月12日].
- ^ （英文）Windows Install. [2008年1月9日]. （原始内容存档于2007年10月25日）.