逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶

逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶(英語:Retroviral aspartyl protease或retropepsins)是來自逆轉錄病毒反轉錄轉座子杆狀DNA病毒(植物雙鏈DNA病毒)的單域天冬氨酸蛋白酶。這些蛋白酶通常是較大的DNA聚合酶群特異性抗原的一部分。逆轉錄病毒蛋白酶與雙結構域真核天冬氨酸蛋白酶的單個結構域同源,例如胃蛋白酶組織蛋白酶腎素Pfam PF00026MEROPS A1)。胃蛋白酶是MEROPS A2,AA家族的成員。(所有已知的成員都是內肽酶

逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶
HIV-1蛋白酶二聚體為白色和灰色,肽底物為黑色,活性位點天冬氨酸側鏈為紅色。 (PDB 1KJF)
鑑定
標誌RVP
PfamPF00077舊版
InterPro英語InterProIPR001995
PROSITE英語PROSITEPDOC00128
MEROPSA2
SCOP英語Structural Classification of Proteins1ida / SUPFAM
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database家族100
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database蛋白2q63
膜蛋白數據庫英語Membranome532

逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶僅作為蛋白二聚體具有活性,因為每個同源二聚體都對應於真核雙葉酶的一半。這兩部分各貢獻一個催化性天冬氨酰殘基[1]

逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶作為DNA聚合酶多聚蛋白的一部分合成,該多聚蛋白包含天冬氨酰蛋白酶、逆轉錄酶核糖核酸酶H整合酶。DNA聚合酶多聚蛋白經過特定的酶促切割以產生成熟的蛋白質。

並非所有由DNA聚合酶產生的逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶都是嚴格意義上的逆胃蛋白酶。來自泡沫逆轉錄病毒亞科的海綿蛋白酶的差異足以產生自己的家族,MEROPS A9。在AA家族中可以找到許多其他示例。

含有該結構域的人類蛋白質 編輯

參考文獻 編輯

  1. ^ Pettit, Steven C.; Everitt, Lorraine E.; Choudhury, Sumana; Dunn, Ben M.; Kaplan, Andrew H. Initial Cleavage of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 GagPol Precursor by Its Activated Protease Occurs by an Intramolecular Mechanism. Journal of Virology. 2004-8, 78 (16) [2022-09-11]. ISSN 0022-538X. PMID 15280456. doi:10.1128/JVI.78.16.8477-8485.2004. (原始內容存檔於2022-09-11). 

參見 編輯

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