北海道大學綜合博物館（日語：ほっかいどうだいがくそうごうはくぶつかん）是一家由國立大學法人北海道大學設置的博物館。
設立北海道大學綜合博物館的討論自1960年代就已經開始，但到1999年文部省才允許設立[1]。綜合博物館展示北海道大學自札幌農學校建校以來140年的探究成果，由位於札幌校區的本館、札幌農學校第二農場和函館校區的水產科學館三座設施構成。
