趨化因子
趨化因子(chemokines)也稱趨化激素、趨化素或化學激素,是由細胞分泌的信號傳送蛋白,屬於小型細胞因子家族成員,因具有誘導附近應答細胞定向趨化的能力而得名。趨化因子蛋白的共同結構特徵包括:分子量小(約8-10 千道爾頓),有四個位置保守的半胱胺酸殘基以保證其三級結構。
趨化因子 Small cytokines (intecrine/chemokine), interleukin-8 like | |||||||||||
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鑑定 | |||||||||||
標誌 | IL8 | ||||||||||
Pfam | PF00048(舊版) | ||||||||||
InterPro | IPR001811 | ||||||||||
PROSITE | PDOC00434 | ||||||||||
SCOP | 3il8 / SUPFAM | ||||||||||
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某些趨化因子歷史上還有其他的名字,包括已知的SIS細胞因子家族、 SIG細胞因子家族,SYC細胞因子家族和血小板因子-4家族。有的趨化因子被認為促進炎症反應,而有些趨化因子被認為在正常的修復過程或發育中控制細胞的遷徙。在所有脊椎動物和一些病毒和一些細菌中有趨化因子存在,但不存在於其他無脊椎動物。這些蛋白質結合到趨化因子受體而起作用,趨化因子受體是G蛋白偶聯受體,選擇性地表現在靶細胞表面。[1]
功能
編輯趨化因子的主要作用是趨化細胞的遷移. 細胞沿著趨化因子濃度增加的信號向趨化因子源處的遷徙。有些趨化因子在免疫監視過程中控制免疫細胞趨化,如誘導淋巴球到淋巴結。 這些淋巴結中的趨化因子通過與這些組織中的抗原提呈細胞相互作用而監視病原體的入侵。這些被稱為穩態趨化因子,其產生無需刺激而分泌。有些趨化因子在發育中起作用;他們能刺激新血管形成; 提供具體的關鍵信號而促成細胞成熟。其他趨化因子可以因應對細菌感染、病毒感染由多種細胞釋放;也可以因非感染性的刺激如二氧化矽吸入,尿路結石等而釋放。趨化因子的釋放還可刺激釋放炎症細胞因子如白血球介素1(IL-1)。 炎性趨化因子的主要作用是趨化白血球(如單核顆粒球和嗜中性球)從血循環到感染或組織損傷部位。有的趨化因子也可以促進傷口癒合。
結構特徵
編輯隸屬於趨化因子的蛋白質不僅因為他們能夠趨化吸引細胞, 而且還其基於其結構特點。趨化因子的分子量小, 多為8至10千道爾頓。他們大約有20-50%的序列完全相同; 也就是說他們分享基因序列和胺基酸序列。趨化因子還擁有保守的胺基酸,對其創造自己的三維或三級結構尤為重要。在大多數情況下,四個半胱胺酸殘基形成兩對雙硫鍵以構成趨化因子的特殊結構。這種分子內的二硫鍵常常是第一與第三,而第二與第四個半胱胺酸殘基之間形成。典型的趨化因子蛋白先合成為多肽前體,包括大約20個胺基酸殘基的信號肽。在成熟的趨化因子被細胞分泌時信號肽被切除。
類型
編輯CC chemokines | ||||
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Name | Gene | Other name(s) | Receptor | Uniprot |
CCL1 | Scya1 | I-309, TCA-3 | CCR8 | |
CCL2 | Scya2 | MCP-1 | CCR2 | P13500 |
CCL3 | Scya3 | MIP-1a | CCR1 | P10147 |
CCL4 | Scya4 | MIP-1β | CCR1, CCR5 | P13236 |
CCL5 | Scya5 | RANTES | CCR5 | P13501 |
CCL6 | Scya6 | C10, MRP-2 | CCR1 | P27784 |
CCL7 | Scya7 | MARC, MCP-3 | CCR2 | P80098 |
CCL8 | Scya8 | MCP-2 | CCR1, CCR2B, CCR5 | P80075 |
CCL9/CCL10 | Scya9 | MRP-2, CCF18, MIP-1? | CCR1 | P51670 |
CCL11 | Scya11 | Eotaxin | CCR2, CCR3, CCR5 | P51671 |
CCL12 | Scya12 | MCP-5 | Q62401 | |
CCL13 | Scya13 | MCP-4, NCC-1, Ckβ10 | CCR2, CCR3, CCR5 | Q99616 |
CCL14 | Scya14 | HCC-1, MCIF, Ckβ1, NCC-2, CCL | CCR1 | Q16627 |
CCL15 | Scya15 | Leukotactin-1, MIP-5, HCC-2, NCC-3 | CCR1, CCR3 | Q16663 |
CCL16 | Scya16 | LEC, NCC-4, LMC, Ckβ12 | CCR1, CCR2, CCR5, CCR8 | O15467 |
CCL17 | Scya17 | TARC, dendrokine, ABCD-2 | CCR4 | Q92583 |
CCL18 | Scya18 | PARC, DC-CK1, AMAC-1, Ckβ7, MIP-4 | P55774 | |
CCL19 | Scya19 | ELC, Exodus-3, Ckβ11 | CCR7 | Q99731 |
CCL20 | Scya20 | LARC, Exodus-1, Ckβ4 | CCR6 | P78556 |
CCL21 | Scya21 | SLC, 6Ckine, Exodus-2, Ckβ9, TCA-4 | CCR7 | O00585 |
CCL22 | Scya22 | MDC, DC/β-CK | CCR4 | O00626 |
CCL23 | Scya23 | MPIF-1, Ckβ8, MIP-3, MPIF-1 | CCR1 | P55773 |
CCL24 | Scya24 | Eotaxin-2, MPIF-2, Ckβ6 | CCR3 | O00175 |
CCL25 | Scya25 | TECK, Ckβ15 | CCR9 | O15444 |
CCL26 | Scya26 | Eotaxin-3, MIP-4a, IMAC, TSC-1 | CCR3 | Q9Y258 |
CCL27 | Scya27 | CTACK, ILC, Eskine, PESKY, skinkine | CCR10 | Q9Y4X3 |
CCL28 | Scya28 | MEC | CCR3, CCR10 | Q9NRJ3 |
CXC chemokines | ||||
Name | Gene | Other name(s) | Receptor | Uniprot |
CXCL1 | Scyb1 | Gro-a, GRO1, NAP-3, KC | CXCR2 | P09341 |
CXCL2 | Scyb2 | Gro-β, GRO2, MIP-2a | CXCR2 | P19875 |
CXCL3 | Scyb3 | Gro-?, GRO3, MIP-2β | CXCR2 | P19876 |
CXCL4 | Scyb4 | PF-4 | CXCR3B | P02776 |
CXCL5 | Scyb5 | ENA-78 | CXCR2 | P42830 |
CXCL6 | Scyb6 | GCP-2 | CXCR1, CXCR2 | P80162 |
CXCL7 | Scyb7 | NAP-2, CTAPIII, β-Ta, PEP | P02775 | |
CXCL8 | Scyb8 | IL-8, NAP-1, MDNCF, GCP-1 | CXCR1, CXCR2 | P10145 |
CXCL9 | Scyb9 | MIG, CRG-10 | CXCR3 | Q07325 |
CXCL10 | Scyb10 | IP-10, CRG-2 | CXCR3 | P02778 |
CXCL11 | Scyb11 | I-TAC, β-R1, IP-9 | CXCR3, CXCR7 | O14625 |
CXCL12 | Scyb12 | SDF-1, PBSF | CXCR4, CXCR7 | P48061 |
CXCL13 | Scyb13 | BCA-1, BLC | CXCR5 | O43927 |
CXCL14 | Scyb14 | BRAK, bolekine | O95715 | |
CXCL15 | Scyb15 | Lungkine, WECHE | Q9WVL7 | |
CXCL16 | Scyb16 | SRPSOX | CXCR6 | Q9H2A7 |
CXCL17 | VCC-1 | DMC, VCC-1 | Q6UXB2 | |
C chemokines | ||||
Name | Gene | Other name(s) | Receptor | Uniprot |
XCL1 | Scyc1 | Lymphotactin a, SCM-1a, ATAC | XCR1 | P47992 |
XCL2 | Scyc2 | Lymphotactin β, SCM-1β | XCR1 | Q9UBD3 |
CX3C chemokines | ||||
Name | Gene | Other name(s) | Receptor | Uniprot |
CX3CL1 | Scyd1 | Fractalkine, Neurotactin, ABCD-3 | CX3CR1 | P78423 |
參看
編輯註釋
編輯- ^ Mélik-Parsadaniantz, Stéphane; Rostène, William. Chemokines and neuromodulation. Journal of Neuroimmunology. 2008, 198 (1–2): 62–8. PMID 18538863. doi:10.1016/j.jneuroim.2008.04.022.