截至2019年，中華民國福建省法理上轄有兩個二級行政區，全數為縣，分別為金門縣和連江縣。其中，前者是中華民國福建省最大、人口數最多、人口密度最大和下轄三級行政區數最多的二級行政區，面積為151.6560平方公里，人口共139,273人，人口密度為每平方公里918人，下轄6個三級行政區（3鄉、3鎮）；後者則是中華民國福建省最小、人口數最少、人口密度最小和下轄三級行政區數最少的二級行政區，面積為28.8000平方公里，人口共13,056人，人口密度為每平方公里453人，下轄4個三級行政區（4鄉）。中華民國福建省的兩縣皆由離島組成，故全境皆被海洋包圍。
