布雷-柯蒂斯相異度

布雷-柯蒂斯相異度(英語:Bray–Curtis dissimilarity)是一個生態學生物學術語,由J. Roger Bray和John T. Curtis[1]提出,基於物種多度對不同樣地物種組成差異進行衡量的測度。其計算公式是:

其中,分別是兩個調查樣地的編號,是兩個樣地共有物種的多度較小值之和,分別是兩個樣地的物種多度之和。關於計算的拓展閱讀請參見Legendre & Legendre[2]

布雷-柯蒂斯相異度介於0和1之間,0意味着兩個調查樣地的物種組成完全相同,而1則表示兩個調查樣地的物種組成完全不同。

布雷-柯蒂斯相異度經常被誤認為是一種距離測度("距離的定義應當基於三角不等式,但是很多差異性的度量並不具有該屬性,為了區別這些差異性度量和距離度量,我們稱它們為『相異度』」[3]))。由於它不滿足三角不等式,我們應當稱之為「相異度」而非「距離」,以避免混淆。一些軟件如mothur軟件包提供了計算大量調查樣地之間相異度的方法[4]

布雷-柯蒂斯相異度和雅卡爾指數(英語:Jaccard index)相似,但是由於布雷-柯蒂斯相異度是半度量的,所以雅卡爾指數可能會是更好的選擇[5]

參考文獻

編輯
  1. ^ Bray, J. R. and J. T. Curtis. 1957. An ordination of upland forest communities of southern Wisconsin. Ecological Monographs 27:325-349.
  2. ^ Pierre Legendre & Louis Legendre. 1998. Numerical ecology. 2nd English edition. Elsevier Science BV, Amsterdam.
  3. ^ Chapter 5 Measures of distance between samples: non-Euclidean (PDF). [2019-10-10]. (原始內容存檔 (PDF)於2017-10-16). 
  4. ^ Braycurtis - mothur. www.mothur.org. [2019-10-10]. (原始內容存檔於2015-02-20). 
  5. ^ R: Dissimilarity Indices for Community Ecologists. cc.oulu.fi. [2019-10-10]. (原始內容存檔於2019-07-29). 

延伸閱讀

編輯
  • Czekanowski J (1909) Zur Differentialdiagnose der Neandertalgruppe. Korrespbl dt Ges Anthrop 40: 44–47.
  • Somerfield, PJ (2008) Identification of Bray-Curtis similarity index: comment on Yoshioka (2008). Mar Ecol Prog Ser 372: 303–306.
  • Yoshioka PM (2008) Misidentification of the Bray-Curtis similarity index. Mar Ecol Prog Ser 368: 309–310. http://doi.org/10.3354/meps07728