1953年3月20日，以第十一軍軍部為基礎，在山東濰坊成立中國人民解放軍空軍第五軍。後遷至福建泉州。1954年4月調駐浙江杭州。1954年6月，空軍第三、第十二師歸該軍領導。之後，該軍還領導4個飛行師、1個高炮師和6個獨立團。1976年1月，空軍第五軍建制撤銷[1][2]。
1960年8月1日，成立中國人民解放軍昆明軍區空軍指揮所。1976年4月15日，將昆明軍區空軍指揮所改為新的中國人民解放軍空軍第五軍。1978年11月1日，改為中國人民解放軍昆明軍區空軍指揮所。1985年昆明軍區撤銷，1987年昆明軍區空軍指揮所改為中國人民解放軍成都軍區空軍昆明指揮所。從1978年至1993年，執行軍級權限。1993年1月縮編為中國人民解放軍空軍昆明基地，執行副軍級權限[1]。2003年12月縮編為中國人民解放軍空軍昆明指揮所，正師級。在2016年深化國防和軍隊改革前，空軍昆明指揮所隸屬中國人民解放軍成都軍區空軍。2016年轉隸中國人民解放軍南部戰區空軍[3][4]。2017年，升格為中國人民解放軍空軍昆明基地，執行副軍級權限[5][6]。
- 軍長
- 謝斌 少將（1956年6月—1958年7月）
- 高厚良 少將（1958年9月—1959年4月）
- 安志敏 少將（1959年4月—1963年8月）
- 黃徑琛 少將（1963年8月—1968年5月）
- 白宗善（1968年5月—1976年1月）
- 李向民（1976年4月—1978年10月）
- 副軍長
- 吳林煥（1953年5月—1956年6月）
- 安志敏（1954年6月—1954年12月）
- 袁彬（1954年12月—1958年7月）
- 王汝眧（1957年8月24日—1958年5月）
- 葉泰清（1958年9月—1976年1月）
- 姬應伍（1959年4月—1960年3月18日）
- 白宗善（1960年3月18日—1968年5月）
- 孫同盛（1965年7月—1971年2月）
- 王海（1965年11月—1969年11月5日）
- 褚福田（1969年9月1日—1970年12月14日）
- 焦景文（1969年9月1日—1976年1月25日）
- 馬運河（1970年12月14日—1971年10月22日）
- 杜群（1970年12月14日—1976年1月25日）
- 朱剛（1976年6月—1978年1月）
- 閻秀文（1976年6月—1978年1月）
- 侯書軍（1977年10月—1978年10月）
- 胡開德（1978年1月—1978年10月31日）
- 廖堅持（1978年1月—1978年10月）
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- 政治委員
- 裴志耕 少將（1954年4月—1958年7月18日）
- 韋祖珍 少將（1959年6月—1964年7月）
- 陳勵耘 大校（1964年7月—1971年9月22日）
- 馮健（1970年12月14日—1971年10月22日，第二政治委員）
- 白宗善（1971年10月22日—1971年11月24日，軍長兼）
- 劉昂（1971年11月21日—1976年1月）
- 李發應（1976年4月—1978年1月）
- 李建明（1978年1月—1978年10月）
- 副政治委員
- 張雍耿（1957年9月27日—1958年7月18日）
- 劉鶴孔（1958年9月27日—1964年10月）
- 王維國（1965年8月26日—1967年2月）
- 山谷秀（1969年3月1日—1976年1月25日）
- 馮鍵（1969年9月1日—1970年12月，第一副政治委員）
- 王是橋（1970年12月14日—1971年10月22日）
- 陳令雲（1971年11月11日—1976年1月）
- 趙世英（1976年6月—1978年10月31日）
- 劉曉峰（1976年6月—1978年1月）
- 葛虹（1976年6月—1978年10月31日）
- 黃則奇（1978年1月24日—1978年10月31日）
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- 參謀長
- 王汝昭（1953年3月—1957年8月24日）
- 孫同盛（1957年8月24日—1963年6月）
- 白宗善（1963年6月—1966年5月，副軍長兼）
- 吳雲山（1966年5月—1969年11月5日）
- 馬運河（1969年11月5日—1970年12月14日；1970年12月14日—1971年10月22日，副軍長兼）
- 傅喜峰（1971年11月11日—1976年1月25日）
- 張磊（1976年6月—1978年1月24日）
- 胡開德（1978年1月24日—1978年10月31日，副軍長兼）
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- 政治部主任
- 裴志耕（1953年3月—1954年4月）
- 張雍耿（1954年4月—1957年5月）
- 崔文斌（1957年5月—1960年3月18日）
- 陳舒懷（1960年3月18日—1965年5月27日）
- 王維國（1965年8月26日—1967年2月，副政治委員兼）
- 馮鍵（1968年6月—1969年9月1日）
- 王是橋（1969年8月30日—1970年12月14日；1970年12月14日—1971年10月22日，副政治委員兼）
- 陳令雲（1971年11月11日—1976年1月25日）
- 李鳴鐸（1976年6月—1977年10月）
- 張進凡（1977年10月—1978年10月31日）
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- 主任
- 劉懋功 少將（1960年8月—1968年4月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 馬傑三（1968年5月—1971年11月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 李向民（1975年5月—1976年4月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 侯書軍（1979年2月—1983年5月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 宋占元（1983年5月—1985年8月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 李長根（1987年9月—1988年9月）
- 王春瑞 空軍少將（1988年12月—1990年6月）
- 姜寶富 空軍少將（1990年6月—1993年1月）
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- 政治委員
- 崔文斌 少將（1960年8月—1969年3月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 任敬湯（1969年3月—1973年12月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 李發應（1974年1月—1976年4月，昆明軍區空軍指揮所主任）
- 李建明（1978年10月31日—1983年5月，昆明軍區空軍指揮所政治委員）
- 王培祿（1983年5月—1985年8月，昆明軍區空軍指揮所政治委員）
- 安基業 空軍少將（1987年9月—1990年6月）
- 劉振起 空軍少將（1990年6月—1992年12月）
- 許傳功 空軍少將（1992年12月—1993年1月）
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- 司令員
- 姜寶富 空軍少將（1993年1月—1994年12月）
- 朱心文 空軍少將（1994年12月—1997年12月）
- 景文春 空軍少將（1997年12月—2000年12月）
- 莊可柱 空軍少將（2000年12月—2003年12月）
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- 政治委員
- 許傳功 空軍少將（1993年1月—1997年3月）
- 胡長生 空軍少將（1997年3月—1997年11月）
- 荊樹森 空軍少將（1997年11月—2001年12月）
- 齊海田 空軍少將（2001年12月—2003年12月）
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- 司令員
- 莊可柱 空軍少將（2003年12月—2004年7月）
- 黃國顯 空軍少將（2004年7月—2005年8月）
- 邵文福 空軍大校（2005年8月—2006年12月）
- 周軍 空軍少將（2006年12月—）[7][8]
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- 政治委員
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